Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms