Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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