Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AP000894.2-201ENST00000581719 3902 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZSCAN29-201ENST00000396972 2831 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GRIK3-202ENST00000373093 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 Z82186.1-201ENST00000434707 4364 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF197-202ENST00000344387 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CDC42EP3-206ENST00000611976 5124 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ACAN-203ENST00000558207 4159 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NOD2-201ENST00000300589 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SYS1-204ENST00000426004 2915 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CSMD2-203ENST00000373377 3212 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 DCAF12-201ENST00000361264 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MOB4-202ENST00000323303 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC100827.4-201ENST00000563464 2441 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ARHGAP44-201ENST00000262444 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 3192 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZMIZ2-201ENST00000265346 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ARHGEF26-205ENST00000496710 3781 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NRXN3-218ENST00000635466 5254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 EYA1-204ENST00000388741 3404 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CAPN3-203ENST00000349748 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TRPC7-206ENST00000513104 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 C16orf96-201ENST00000444310 3823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 C5orf66-205ENST00000555438 3246 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 WDR91-202ENST00000423565 4500 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GPRASP2-205ENST00000543253 3935 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms