Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms