Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms