Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCMTD1Q96MG8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms