Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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RABGGTAQ92696 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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RABGGTAQ92696 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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RABGGTAQ92696 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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