Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWW0

LCN15, Lipocalin-15, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN15Q6UWW0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LCN15Q6UWW0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN15Q6UWW0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms