Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms