Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 COG4-210ENST00000564315 729 ntTSL 28.12□□□□□ -1.112e-10■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-206ENST00000484604 794 ntTSL 27.94□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.185e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 27.61□□□□□ -1.195e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-212ENST00000474431 644 ntTSL 57.39□□□□□ -1.235e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 KIF20B-203ENST00000447580 660 ntTSL 57.15□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-210ENST00000529421 801 ntTSL 37.1□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RTCB-205ENST00000487704 767 ntTSL 26.83□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 46.52□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-209ENST00000528619 731 ntTSL 26.1□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 56.06□□□□□ -1.445e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.461e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 AC008575.2-204ENST00000509024 474 ntTSL 25.39□□□□□ -1.555e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-204ENST00000422222 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.26□□□□□ -1.575e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-211ENST00000530245 530 ntTSL 35.24□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.615e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-209ENST00000459746 628 ntTSL 34.75□□□□□ -1.655e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-211ENST00000512333 579 ntTSL 44.48□□□□□ -1.695e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-213ENST00000533567 594 ntTSL 34.11□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.785e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 43.68□□□□□ -1.825e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-214ENST00000472582 768 ntTSL 33.64□□□□□ -1.835e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-213ENST00000471681 3120 ntTSL 53.45□□□□□ -1.865e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-202ENST00000341455 3042 ntTSL 1 (best)3.34□□□□□ -1.885e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TBK1-208ENST00000545392 408 ntTSL 33.29□□□□□ -1.885e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-205ENST00000422788 762 ntTSL 33.06□□□□□ -1.925e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DLG1-222ENST00000470629 416 ntTSL 33.03□□□□□ -1.925e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SRP19-205ENST00000506987 727 ntTSL 22.94□□□□□ -1.945e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EIF4E-207ENST00000505829 429 ntTSL 32.94□□□□□ -1.945e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DESI2-203ENST00000418162 486 ntTSL 52.85□□□□□ -1.955e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.975e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.025e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.055e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.395e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 IFRD2-206ENST00000462001 891 ntTSL 218.85■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 IFRD2-212ENST00000484043 614 ntTSL 413.66□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RPLP0-211ENST00000548495 651 ntTSL 39.49□□□□□ -0.895e-18■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PTPN23-206ENST00000602307 5119 ntTSL 212.7□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 312.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEX10-205ENST00000508384 611 ntTSL 321.97■■□□□ 1.116e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 OGFOD3-204ENST00000577606 598 ntTSL 419.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ESRP2-205ENST00000562738 590 ntTSL 414.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 IFRD2-207ENST00000464258 902 ntTSL 211.03□□□□□ -0.649e-8■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PLA2G4B-203ENST00000461382 1530 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-11■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.095e-11■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 KPNA6-204ENST00000471599 3941 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 COL16A1-205ENST00000458715 706 ntTSL 515.02■□□□□ -03e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MLXIP-211ENST00000542417 513 ntTSL 214.89□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 COL16A1-211ENST00000479100 740 ntTSL 514.84□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MLXIP-210ENST00000541750 2835 ntTSL 514.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MLXIP-202ENST00000366272 1682 ntTSL 314.56□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 COL16A1-208ENST00000468459 620 ntTSL 514.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SHMT2-208ENST00000553868 941 ntTSL 214.4□□□□□ -0.15e-9■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NEMF-209ENST00000556074 3047 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 NEMF-214ENST00000557193 737 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 NEMF-204ENST00000554275 873 ntTSL 34.31□□□□□ -1.725e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 NEMF-211ENST00000556691 2062 ntTSL 23.16□□□□□ -1.95e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 UCKL1-206ENST00000492660 545 ntTSL 212.96□□□□□ -0.338e-8■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-215ENST00000481477 2761 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-202ENST00000399201 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-204ENST00000399207 1160 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 518.69■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 515.28■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-212ENST00000595920 431 ntTSL 319.91■□□□□ 0.783e-10■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DVL2-202ENST00000571745 560 ntTSL 415.29■□□□□ 0.049e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.164e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 CALR-206ENST00000588454 776 ntTSL 310.23□□□□□ -0.775e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DROSHA-204ENST00000504361 583 ntTSL 311.11□□□□□ -0.634e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.74e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.714e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 SLC12A4-215ENST00000575857 588 ntTSL 310.55□□□□□ -0.722e-14■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DROSHA-207ENST00000507438 860 ntTSL 410.52□□□□□ -0.734e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DOLPP1-205ENST00000480255 344 ntTSL 56.28□□□□□ -1.44e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.524e-12■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 CXXC1-214ENST00000590901 2562 ntTSL 216.08■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 36.4
EFTUD2Q15029 ITGA5-213ENST00000553071 1013 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 319■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 ING5-210ENST00000492488 822 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 214.27□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 36.3
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