Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFT88Q13099 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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