Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TMEM258P61165 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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