Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3AP57075 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms