Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE1P56817 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE1P56817 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE1P56817 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE1P56817 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE1P56817 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE1P56817 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms