Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLTPP55058 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLTPP55058 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms