Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HBE1P02100 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HBE1P02100 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBE1P02100 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBE1P02100 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms