Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE40O14503 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms