Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NMNAT2-202ENST00000294868 5448 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GAREM1-202ENST00000399218 7033 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNA2-211ENST00000639233 5256 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LILRA1-202ENST00000453777 2313 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GLI1-207ENST00000543426 3394 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ERCC5-202ENST00000375954 2986 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RD3-201ENST00000367002 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MTO1-205ENST00000415954 2837 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MASTL-202ENST00000375940 3080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR3C-201ENST00000334163 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GBAP1-201ENST00000368374 1873 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1324-203ENST00000369939 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093390.1-201ENST00000426976 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIA1-209ENST00000518783 5233 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 COL25A1-209ENST00000622134 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PAQR7-201ENST00000374296 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PHKA1-203ENST00000373542 6020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RHOT1-210ENST00000581094 3231 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MINOS1-201ENST00000322753 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PRRG3-201ENST00000370353 5977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms