Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359924.1-201ENST00000450451 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KLK2-203ENST00000391810 2674 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD4-201ENST00000395288 2460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGER4-201ENST00000302472 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 JADE1-213ENST00000610919 5644 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-202ENST00000399066 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHSD1-201ENST00000435817 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HHAT-202ENST00000367009 2714 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms