Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A8Q9Y2E8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A8Q9Y2E8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms