Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 INPP5A-204ENST00000423490 416 ntTSL 56.05□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 195.1
UTP3Q9NQZ2 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 195.1
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-204ENST00000525616 780 ntTSL 222.99■■□□□ 1.271e-8■■■■■ 195.1
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-203ENST00000524771 713 ntTSL 317.63■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 195.1
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-206ENST00000526224 578 ntTSL 310.67□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 195.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-203ENST00000606225 1950 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 195
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-214ENST00000635324 799 ntTSL 58.72□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 195
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-213ENST00000635270 830 ntTSL 58.14□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 195
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-217ENST00000635514 790 ntTSL 57.97□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 195
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.397e-7■■■■■ 195
UTP3Q9NQZ2 GATAD2B-207ENST00000634791 642 ntTSL 39.19□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 TESC-202ENST00000462502 854 ntTSL 522.25■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 TESC-203ENST00000470612 1057 ntTSL 221.67■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 TESC-204ENST00000482176 841 ntTSL 320.75■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 194.9
UTP3Q9NQZ2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 194.8
UTP3Q9NQZ2 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 194.7
UTP3Q9NQZ2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 194.7
UTP3Q9NQZ2 TPM3-220ENST00000509601 543 ntTSL 419.06■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 216.33■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.118e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 214.08□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-209ENST00000368527 569 ntTSL 410.81□□□□□ -0.688e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-210ENST00000368530 1523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.898e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 58.59□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 28.58□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 194.6
UTP3Q9NQZ2 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 194.4
UTP3Q9NQZ2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 194.3
UTP3Q9NQZ2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 194.3
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 194.2
UTP3Q9NQZ2 NSD2-213ENST00000503207 812 ntTSL 315.18■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 194
UTP3Q9NQZ2 BRD9-207ENST00000489093 1139 ntTSL 314.88□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 193.9
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-211ENST00000474131 512 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 193.9
UTP3Q9NQZ2 LRPAP1-201ENST00000296325 1078 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 LRPAP1-204ENST00000515119 1167 ntTSL 216.26■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 NEK8-202ENST00000543014 2055 ntTSL 221.48■■□□□ 1.035e-8■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 NEK8-201ENST00000268766 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 AC135050.2-202ENST00000532364 499 ntTSL 422.75■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 SOS1-204ENST00000451331 579 ntTSL 417.51■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 193.8
UTP3Q9NQZ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.533e-8■■■■■ 193.7
UTP3Q9NQZ2 GGA2-206ENST00000566547 603 ntTSL 223.7■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 193.7
UTP3Q9NQZ2 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 193.7
UTP3Q9NQZ2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 193.6
UTP3Q9NQZ2 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 193.6
UTP3Q9NQZ2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 193.6
UTP3Q9NQZ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.546e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.46e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ABCB6-202ENST00000295750 2238 ntTSL 518.58■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ARFIP2-209ENST00000531037 1560 ntTSL 317.57■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 315.02■□□□□ -02e-19■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 193.5
UTP3Q9NQZ2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 193.4
UTP3Q9NQZ2 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 218.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 193.3
UTP3Q9NQZ2 HERC1-205ENST00000559886 2462 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 193.3
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)23.43■■□□□ 1.344e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 FAM3C-203ENST00000426156 662 ntTSL 528.73■■■□□ 2.197e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 FAM3C-202ENST00000412653 561 ntTSL 417.52■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 193
UTP3Q9NQZ2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 192.9
UTP3Q9NQZ2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-32■■■■■ 192.8
UTP3Q9NQZ2 MRPL30-201ENST00000338148 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-32■■■■■ 192.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 192.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 192.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 977.8 ms