Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms