Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBL7Q96S82 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms