Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms