Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms