Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms