Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RGS12-222ENST00000513784 710 ntTSL 216.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 53.5
TBRG4Q969Z0 RPTOR-204ENST00000572733 424 ntTSL 39.25□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 53.5
TBRG4Q969Z0 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 53.4
TBRG4Q969Z0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 53.3
TBRG4Q969Z0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 53.2
TBRG4Q969Z0 ANKFY1-211ENST00000575298 665 ntTSL 512.91□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 53.2
TBRG4Q969Z0 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 53.2
TBRG4Q969Z0 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 53.2
TBRG4Q969Z0 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 26.81□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 53.2
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 511.58□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 53.2
TBRG4Q969Z0 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)22.28■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 53.1
TBRG4Q969Z0 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 53.1
TBRG4Q969Z0 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 53.1
TBRG4Q969Z0 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 53.1
TBRG4Q969Z0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 AFTPH-207ENST00000498706 4674 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.968e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-202ENST00000474840 702 ntTSL 1 (best)25.99■■□□□ 1.758e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.348e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-203ENST00000491999 1050 ntTSL 523.03■■□□□ 1.288e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)21.76■■□□□ 1.078e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 321.74■■□□□ 1.078e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 13e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-210ENST00000620462 1594 ntTSL 518.89■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-209ENST00000581031 3013 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-206ENST00000615744 1379 ntTSL 318.34■□□□□ 0.538e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-204ENST00000575894 1728 nt18.18■□□□□ 0.58e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-209ENST00000619674 2306 ntTSL 217.58■□□□□ 0.48e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.348e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-215ENST00000583994 3289 ntTSL 216.58■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 53
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TBRG4Q969Z0 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 215.95■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 215.67■□□□□ 0.18e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 SPSB1-204ENST00000450402 822 ntTSL 515.11■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 CCP110-211ENST00000573412 673 ntTSL 313.87□□□□□ -0.192e-11■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 513.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.258e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.288e-8■■■■■ 53
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TBRG4Q969Z0 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.368e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 FAM171A1-203ENST00000477161 617 ntTSL 312.67□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MBTPS1-216ENST00000570064 3086 ntTSL 212.44□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GANAB-207ENST00000526732 824 ntTSL 212.43□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 CCP110-210ENST00000569190 2600 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-11■■■■■ 53
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TBRG4Q969Z0 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.588e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.628e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 TSHZ1-202ENST00000560661 551 ntTSL 410.93□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 VSNL1-201ENST00000295156 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-210ENST00000581094 3231 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 CCP110-207ENST00000565376 698 ntTSL 310.03□□□□□ -0.82e-11■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.898e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MBTPS1-207ENST00000564049 594 ntTSL 48.95□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MBTPS1-202ENST00000561936 708 ntTSL 58.9□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 GOLGA1-204ENST00000475407 4107 ntTSL 58.1□□□□□ -1.118e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DNMT1-219ENST00000589349 603 ntTSL 48.02□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 DNMT1-224ENST00000591764 341 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-206ENST00000578205 2771 ntTSL 1 (best)4□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-208ENST00000580976 567 ntTSL 43.55□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 MBTD1-207ENST00000593259 550 ntTSL 51.85□□□□□ -2.118e-8■■■■■ 53
TBRG4Q969Z0 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 52.7
TBRG4Q969Z0 WDR20-215ENST00000558448 611 ntTSL 39.83□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 52.5
TBRG4Q969Z0 WDR20-218ENST00000559478 422 ntTSL 29.82□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 52.5
TBRG4Q969Z0 WDR20-208ENST00000555973 560 ntTSL 49.35□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 52.5
TBRG4Q969Z0 WDR20-219ENST00000559708 563 ntTSL 35.78□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 52.5
TBRG4Q969Z0 WDR20-214ENST00000558135 585 ntTSL 25.04□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 52.5
TBRG4Q969Z0 PDE4D-215ENST00000506510 558 ntTSL 43.88□□□□□ -1.799e-7■■■■■ 52.5
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