Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PARP8Q8N3A8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PARP8Q8N3A8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms