Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL3Q6DD88 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms