Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDRF1Q3B7T1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms