Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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