Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP1R1AQ13522 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms