Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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