Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNH2Q12809 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNH2Q12809 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms