Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A3Q01959 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms