Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms