Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YY1P25490 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YY1P25490 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YY1P25490 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YY1P25490 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YY1P25490 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YY1P25490 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YY1P25490 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YY1P25490 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YY1P25490 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YY1P25490 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YY1P25490 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms