Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA4P13612 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA4P13612 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA4P13612 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA4P13612 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA4P13612 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA4P13612 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA4P13612 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA4P13612 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms