Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BX005214.3-201ENST00000615174 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 IDH3A-201ENST00000299518 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CES5A-203ENST00000518005 2092 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC096636.1-201ENST00000625140 3618 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DUSP6-201ENST00000279488 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC026887.1-201ENST00000624657 2985 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RAD17-205ENST00000354868 3060 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TPP2-201ENST00000376052 5447 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NKAIN2-202ENST00000368417 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 COPG2-202ENST00000425248 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRIM39-203ENST00000396547 3187 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF827-208ENST00000513320 3165 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SMAD9-202ENST00000379826 5592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GPR155-202ENST00000392551 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GNL3LP1-201ENST00000399458 1643 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ESR1-202ENST00000338799 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC02072-201ENST00000441895 2645 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BEST1-201ENST00000378043 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SOX9-AS1-204ENST00000434703 3032 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.7 ms