Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1Q9Y3L3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1Q9Y3L3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP1Q9Y3L3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP1Q9Y3L3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP1Q9Y3L3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1Q9Y3L3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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