Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms