Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms