Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms