Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPR88Q9GZN0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPR88Q9GZN0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms