Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms