Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms