Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF3BQ9BZI7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms