Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms