Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNBD2Q96M20 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms