Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKD1Q969G9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms